丝瓜猝倒病由真菌瓜果腐霉引起，是丝瓜苗期主要病害。

丝瓜苗被病菌侵染后，茎基部先出现水渍状病斑，后病斑迅速绕茎一周，变为黄褐色；病部软腐，明显缢缩，病苗往往在子叶凋萎前猝倒。病部表皮极易脱落，维管束缢缩，变成像线一样细。潮湿时，病部附近长出白色棉絮状菌丝。

该病病菌分布广泛，在土壤潮湿、连阴雨天多或施用未腐熟农家肥时易发生，常常与其他根腐病共同为害。

在发病严重的地区采用统一供苗移植的办法防治。注意清洁床土，或播种前用800倍液75%敌克松药液喷洒床土。同时可用铜铵合剂防治，此外，25%瑞毒霉可湿性粉剂800~1000倍液、60%杀毒矾可湿性粉剂500倍液、72.2%普力克水剂400~600倍液、69%安克锰锌水分散粒剂或可湿性粉剂1000~1200倍液等均可防治。发病初期喷雾或浇淋，每7~10天喷1次，连喷2~3 次。