红薯不能与马铃薯混储原因有两方面：

一是窖藏期要求温度不同。红薯是喜热作物，种植是在温度高的夏季和早秋，窖藏期最适温度是10—15度，如果温度过低，就会受冷害，严重时产生“硬心”腐烂。马铃薯是喜冷的作物，种植是在低温的早春和晚秋，窖藏期最适温度是1—5度，如果温度过高，就会发芽变青有毒不能食用。

二是窖藏期要求通风透光不同。红薯是块根储藏，冬储时呼吸微弱，需氧量很少，在无光黑暗不通风微氧条件下能安全越冬。马铃薯却不同，它是块茎储藏，冬储时，不仅要有一定的散射光，还必须有充足的氧气。如果缺氧，马铃薯被迫进行无氧呼吸，由于酒精中毒而引起薯块“出汗”从而导致腐烂，所以，冬储就要有很好的通风和适度的透光条件。