若田间发现病株，应立即拔除烧毁，清洁田园，并在拔除部位撒施生石灰粉或草木灰或在病穴灌注2%福尔马林液或20%石灰水。

可采取轮作换茬，拔除零星病株，清除田间病残体等措施防治番茄青枯病。

轮作，清洁田园，土壤消毒杀菌，拨除病株，预防用咯菌腈溶液灌根。

实行轮作，用咯菌腈进行土壤消毒。

选抗病品种，轮作嫁接，喷生物微肥。