洋桔梗常见的主要病害有立枯病、灰霉病、菌核病等，系真菌侵染，高温高湿环境容易导致该病发生。主要危害植株根茎部，发病时洋桔梗茎部皮层组织腐烂。发病初期除了及时拔除病株、摘除病叶和病花，喷施1%的波尔多液，严重时可用50%甲基托布津可湿性粉剂500倍液和50%百草清可湿性粉剂500～800倍液交替使用，每3～5天喷洒一次。也可施用抗枯宁、万霉灵、多菌灵、代森锰锌等药剂进行预防和处理以外，平时要注意加强通风透光；降低植株种植密度；合理施氮肥，适当增加磷钾肥，提高植株抗病能力。

常见的主要虫害有蚜虫、卷叶蛾、斜纹夜蛾、潜叶蝇等危害，根据发生情况，可用40％乐果乳油1500倍液喷杀。