经过灭菌处理后，就进入了接种阶段。当菌棒冷却到室温后，在严格无菌的条件下，精心选择的香菇菌种被引入已经灭菌的菌棒中，然后扎紧袋口并放入适当的恒温恒湿环境中，如温度控制在22-28℃的清洁、通风、避光室内。接下来，开始进行约40-60天的发菌管理。在这期间，定期检查并严格控制湿度和环境卫生，以防止杂菌的侵入，确保香菇菌丝能够顺利地占据菌棒内的每一寸空间。

当菌丝生长充满菌棒后，就会迎来重要的转色和刺孔阶段。所谓转色和刺孔是在菌丝生长成熟后，通过调整环境条件，如将温度降至18-22℃并给予散射光照，来诱导菌丝形成子实体的原基，也就是我们常说的"菇蕾"。然后，在菌棒的表面进行有序的刺孔通气操作，以便氧气能够充分渗透到菌棒内部，为菇蕾的孵化提供必要的气体交换条件。之后，菌棒会被移入特制的出菇棚内进行**出菇管理**。此时，空气相对湿度需要维持在85%-95%，温度控制在12-20℃，并适当提供散射光照和新鲜空气，这样的环境犹如大自然森林的微缩版，为香菇子实体的茁壮成长提供了绝佳的舞台。一般情况下，7-15天后，香菇便会纷纷现蕾而出，宛如一朵朵盛放于暗夜中的黑色精灵。